اولویتهای پژوهشی مرکز تحقیقات آندوکرینولوژی تولیدمثل:

• سندرم تخمدان پلی کیستیک

• یائسگی

• اختلالات غدد و باروری

• تاثیر عوامل مختلف برچرخه ی باروری زنان(بلوغ- سنین باروری –یایسگی) و تاثیر این چرخه بر جنبه های مختلف سلامت زنان

• تاثیر عوامل مختلف بر باروری و ناباروری در زنان و مردان

• بارداری سالم -شیردهی و تاثیر بیماری های مختلف بر پیامدهای بارداری (مادری، نوزادی و کودکی)، و تاثیر متقابل بارداری بر بیماری ها

• سلامت جنسی و رفتارهای جنسی

• مدل سازی حیوانی بیماری ها جهت شناسایی ابعاد ناشناخته و اتیولوژی بیماری ها

• بررسی ابعاد مختلف بیماری ها در حیوانات مدل سازی شده

• ارائه درمانهای نوین بر اساس مدلهای حیوانی

• برنامه ریزی دوران جنینی (fatal programming)