رسالت اصلی پزوهشکده غدد درون ریز و متابولیسم جمع آوری ، طبقه بندی، و بکار گیری آخرین اطلاعات مربوط به علوم غدد درون ریز و متابولیسم و نیز اجرای طرحهای پژوهشی در راستای ارتقاء مراقبت از بیماران و پیشگیری از بیماریهای غیر واگیر می­باشد. همسو با این فعالیت با توجه به امکانات و زیر ساختارها، این پژوهشکده در تربیت نیروهای کارآ که هم اینک در اقصی نقاط کشور مشغول فعالیت های آموزشی و پژوهشی هستند سهیم باشد. بعلاوه این پژوهشکده تربیت دانشجویان در مقطع PhDپزشکی ملکولی را در برنامه کار خود دارد و همزمان با سایر مراکز دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی اقدام به پذیرش دانشجو می­نماید .شایان ذکر است هدایت و آموزش این دانشجویان تا سال 1392 بر عهده پژوهشکده بوده است .در این مقطع تا سال 92 چهار دوره برگزار گردید و در مجموع 34 دانشجو پذیرش شده­اند.

با راه اندازی دوره های PhD by Research  نیز این پژوهشکده موفق به اخذ موافقت گردیده که در مجموع ده دوره برگزاری 21 نفر دانشجو پذیرش کرده است که 16 نفر فارغ التحصیل و 1 نفر در مرحله اجرای پایان نامه و 4 نفر در حال گذراندن دروس عمومی و اختصاصی هستند.

 لازم به توضیح است که دانشجویان دیگری نیز در دوره های کارشناسی ارشد و PhDپس از انعقاد تفاهم نامه هایی پایان نامه خود را در این پژوهشکده می­گذرانند.